Климат Филиппинских островов тропический, муссонный, в южной части страны - субэкваториальный. Можно выделить три сезона: c июня по сентябрь - дождливый период, который определяется муссонами «хабакат» и «амихан», приходящими с северо-востока (температура +24 - 33 С, осадков около 1000 мм.); c октября по февраль - прохладный сухой сезон (самые «прохладные» месяцы - ноябрь и декабрь; в этот период температура днем держится около +28 C, а на побережье по утрам может снижаться до +17 C; осадков до 400 мм.); c марта по май - жаркий сухой сезон (температура порядка +35 С, осадков не более 800 мм.).

Средняя годовая температура на Филиппинах: 27 градуса по Цельсию, влажность 77%. На побережье температура колеблется от 24 до 28 градусов; в горных районах прохладнее, часто бывают заморозки. С востока и северо-востока на северные районы страны (Лусон и Висайские острова) в период с июня по октябрь часто налетают тайфуны (багио (bagyo) - местное название).

На большей части Филиппин влажность превышает 2000 мм, хотя количество выпадающих осадков на протяжении года колеблется. Пик влажности попадает на август. Для европейцев лучшее время визита на Филиппинские острова - период с начала октября до середины мая (жара спадает и влажность воздуха опускается ниже 77%).